Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Brd4Q9ESU6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Brd4Q9ESU6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms