Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hapln2Q9ESM3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hapln2Q9ESM3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hapln2Q9ESM3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hapln2Q9ESM3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hapln2Q9ESM3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hapln2Q9ESM3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hapln2Q9ESM3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hapln2Q9ESM3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hapln2Q9ESM3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hapln2Q9ESM3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hapln2Q9ESM3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hapln2Q9ESM3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms