Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms