Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms