Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrnb2Q9ERK7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms