Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk4Q9ERK0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms