Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms