Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barx1Q9ER42 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barx1Q9ER42 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barx1Q9ER42 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barx1Q9ER42 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barx1Q9ER42 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Barx1Q9ER42 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barx1Q9ER42 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barx1Q9ER42 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barx1Q9ER42 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx1Q9ER42 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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