Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms