Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ80

Nif3l1, NIF3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nif3l1Q9EQ80 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nif3l1Q9EQ80 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nif3l1Q9EQ80 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms