Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms