Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sil1Q9EPK6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms