Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufs3Q9DCT2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms