Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabarapQ9DCD6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms