Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms