Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx6Q9DBY5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms