Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms