Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms