Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med29Q9DB91 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms