Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms