Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms