Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms