Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms