Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H3

Mbd3l1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l1Q9D9H3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms