Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd2Q9D9H2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms