Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms