Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms