Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms