Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af1Q9D883 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms