Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms