Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl40Q9D783 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms