Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf13Q9D777 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms