Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D5Q8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D5Q8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D5Q8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D5Q8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms