Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4f1Q9D5Q6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms