Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5F6

4930447A16Rik, RIKEN cDNA 4930447A16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447A16RikQ9D5F6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447A16RikQ9D5F6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930447A16RikQ9D5F6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms