Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc83Q9D4V3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms