Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf6Q9D4J7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms