Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul2Q9D4H8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul2Q9D4H8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms