Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syce1Q9D495 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms