Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UvssaQ9D479 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UvssaQ9D479 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms