Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933428M09RikQ9D3X3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms