Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms