Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SarnpQ9D1J3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SarnpQ9D1J3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms