Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms