Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1lQ9D1E5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms