Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2cQ9D1C1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2cQ9D1C1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2cQ9D1C1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2cQ9D1C1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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