Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syf2Q9D198 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms