Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm12Q9D0R8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm12Q9D0R8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms