Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca7Q9D0M2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms