Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms